进取号在探索一片未知星云时，全体船员被一种量子意识体“附身”，开始相互攻击，而船长必须分辨谁是真人。
第二季开篇，进取号接到任务：调查一片会吞噬所有信号的异常星云。刚进入星云，船员们开始出现集体幻听，每个人都听到了已故亲人的呼唤。很快，信任瓦解，武器官拔枪指向舵手，医生说医疗舱里全是怪物。亚契船长发现这是一种量子意识体，它们没有恶意，只是孤独，想借用人类的身体体验情感。但不同的意识挤在同一个身体里会导致精神分裂。更糟的是，意识体开始在人之间跳跃，没有人记得自己做过什么。亚契必须设计一套“图灵测试”，在24小时内找出哪些船员还是人类，哪些已被完全占据。而他第一个要测试的，是自己。
本季致敬了经典的科幻母题，但执行极为出色。对信任、孤独与存在的探讨超越了一般太空冒险的格局。克隆人式心理战让人屏息，结尾亚契对着镜子里的自己提问，堪称系列最高光时刻之一。
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