索尼克与塔尔斯、纳克鲁斯联手对抗拥有混沌之力的“暗影”夏特，而蛋头博士带来了祖父的秘密遗产。
索尼克在地球上安了家，但一只名为“暗影”夏特的黑色刺猬从军事监狱中逃脱，拥有强大的混沌之力。蛋头博士突然出现，声称要与索尼克联手，因为夏特释放的是他祖父当年创造的终极生命体。为了阻止夏特启动宇宙毁灭程序，索尼克团队与蛋头博士组成临时联盟。在穿越沙漠、太空和虚拟世界的战斗中，索尼克首次感受到了真正的恐惧与怀疑。最终，他必须超越速度的极限，进入混沌空间与夏特进行一场决定两个星球命运的对决。
游戏改编电影的范本。动作场面全面升级，夏特的引入增加了暗黑深度。金·凯瑞一人分饰两角（蛋头博士和他祖父）贡献了极其疯癫的表演。粉丝彩蛋多到爆炸，新观众也能看嗨。
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